乙型肝炎病毒由于其本身的特点而较容易发生变异，在慢性感染过程中，变异可自发或在治疗后发生。据报道该病毒的每一个基因和每一种病毒蛋白都可发生突变，使其感染后临床表现多样化、临床经过复杂化，以及治疗困难化。

目前已经发现的比较重要的变异有以下几种：

一：可以造成乙肝疫苗接种失败的变异：

二：可以导致“小三阳”慢性乙肝的变异：

三：可以对抗病毒治疗产生耐药的变异，后者主要发生在药物与病毒结合的位置，当病毒基因发生变异时，这些结合位点的空间结构发生改变，药物与病毒的结合能力下降，因而导致病毒耐药。

对于乙肝患者出现乙肝病毒耐药情况或者久治不愈时，可通过乙肝病毒耐药、变异检测系统清楚的监控到乙肝病毒在体内存在的数量，是否复制，是否传染，有没有必要吃药，适合用哪一类抗病毒药物，而且还能够清楚的判定药物的疗效，病毒是否变异耐药等。从而根据具体的病情进行治疗。

专家强调;慢性乙型肝炎患者，抗病毒治疗一定要在医生的指导下进行，定期随访，复查肝功能、肾功能、病毒指标(包括“两对半”、病毒定量、病毒变异情况)、血常规等。不能自行买药，随意吃药，随意停药。医生会根据病情发展、治疗反应、可能出现的副作用等，及时调整用药，决定疗程，以期达到较好治疗效果，**程度上减少肝硬化、肝细胞肝癌的发生。